GBIF發(fā)布新指南，為基因組和宏基因組信息持有者提供參考

近日，作為國內(nèi)第二家具有全球生物多樣性信息網(wǎng)絡（GBIF）數(shù)據(jù)發(fā)布資質(zhì)的科研單位，中國生物多樣性保護與綠色發(fā)展基金會（簡稱“中國綠發(fā)會”、“綠會”）國際部獲悉GBIF秘書處發(fā)布了一份新的指南，名為《通過生物多樣性數(shù)據(jù)平臺發(fā)布DNA衍生數(shù)據(jù)》（Publishing DNA-derived data through biodiversity data platforms），旨在為基因組和宏基因組信息持有者提供參考。

全球基因組生物多樣性聯(lián)盟是連接全球生物多樣性庫、序列數(shù)據(jù)庫和眾多研究成果的網(wǎng)絡門戶，是由多家世界頂級或較大規(guī)模的生物資源樣本庫、研究機構等組成的大規(guī)模生物多樣性聯(lián)盟。

由澳大利亞、愛沙尼亞、挪威、瑞典和丹麥的共同組成的專家作者團隊描述了一些原則和實踐，讓基于DNA的數(shù)據(jù)持有者有興趣在最初的“組學”背景下提高其可用性。

作者包括：

Anders F. Andersson, 瑞典皇家理工學院

Andrew Bissett, 聯(lián)邦科學與工業(yè)研究組織 （CSIRO）

Anders G. Finstad, 挪威科技大學

Frode Foss?y, 挪威自然研究所(NINA)

Marie Grosjean, 丹麥GBIF秘書處

Michael Hope, 澳大利亞生活地圖集和CSIRO國家收藏和海洋基礎設施

Thomas S. Jeppesen, 丹麥GBIF秘書處

Urmas K?ljalg, 愛沙尼亞塔爾圖大學自然歷史博物館和植物園

Daniel Lundin, 瑞典林奈大學

R. Henrik Nilsson, 哥德堡大學，瑞典

Maria Prager, 斯德哥爾摩大學和卡羅林斯卡學院，瑞典

Cecilie Svenningsen, 丹麥自然歷史博物館，丹麥哥本哈根大學

Dmitry Schigel, 丹麥GBIF秘書處

利用遺傳數(shù)據(jù)來檢測、描述、分類和量化分類單元在分子生態(tài)學、系統(tǒng)發(fā)育學和生物多樣性研究的其他領域中已得到廣泛應用。 新的指南幫助這些數(shù)據(jù)的持有者實現(xiàn)將這些數(shù)據(jù)用于更廣泛的生物多樣性研究和政策的潛力。

該指南強調(diào)了社區(qū)的期望，即主要基因組數(shù)據(jù)首先通過國際核苷酸序列數(shù)據(jù)庫協(xié)作(INSDC)共享。 通過其他生物多樣性平臺，數(shù)據(jù)發(fā)布者通過標本、觀察和序列對單一可搜索資源作出貢獻，從而對世界生物多樣性做出更全面的看法。 數(shù)據(jù)的跨平臺索引有助于產(chǎn)生更豐富的數(shù)據(jù)集和更好的元數(shù)據(jù)，而GBIF的數(shù)據(jù)聚類算法確定了自然史和分子生物學中使用的不同證據(jù)來源之間的潛在聯(lián)系。

更多最新消息將通過“綠會融媒”報道。綠會融媒是環(huán)境創(chuàng)變者和第一信息源，致力于分享全球生物多樣性治理的前沿、最新動態(tài)，供國內(nèi)有關部門、專家學者、社會組織和利益相關方參考。

參考鏈接：

https://www.gbif.org/news/6Kc735P6jWueKIw3WIdoYP/new-guide-published-on-sharing-dna-derived-occurrence-data

https://docs.gbif.org/publishing-dna-derived-data/1.0/en/

文/Syying 審/YJ