整合多組學信息顯著提升肉?；蚪M預測準度

近日，中國農(nóng)業(yè)科學院北京畜牧獸醫(yī)研究所牛遺傳育種科技創(chuàng)新團隊通過整合多組學信息，研發(fā)出基因組預測新方法，顯著提升了肉牛重要經(jīng)濟性狀的預測準確性，為揭示復雜性狀遺傳基礎和優(yōu)化基因組選擇策略提供了新思路。相關研究成果發(fā)表在《生物學指南（Biology Direct）》上。

國內(nèi)外研究表明，利用轉(zhuǎn)錄組、表觀組等多組學信息可有效鑒定與表型相關的功能調(diào)控位點，把基因表達、表觀修飾等信息整合到預測模型，可顯著提高預測準確性。研究人員根據(jù)華西牛的43個經(jīng)濟性狀表型和填充測序變異，構建了覆蓋基因組、轉(zhuǎn)錄組、代謝組和表觀組等層次的11個功能單核苷酸多態(tài)性分組，研發(fā)了整合多組學的基因組預測新方法。

研究表明，上述新方法與全基因組測序數(shù)據(jù)相比，高評分的前10%單核苷酸多態(tài)性組的預測準確率大幅提高，貝葉斯B方法模型下預測準確率平均提高11.6%，基因組最佳線性無偏預測方法平均提高7.54%。在與肉牛經(jīng)濟效益顯著相關的日增重和宰前活重兩個性狀上，貝葉斯B方法預測準確率分別提高6.70%和5.73%。

該研究得到了國家重點研發(fā)計劃和國家自然科學基金等項目的資助。（通訊員 付松川）