650多名學者聯(lián)名批評AlphaFold 3不透明丨科技周覽

整理 | 周舒義、望鄉(xiāng)

1.8億年前可能就有“溫血”恐龍了

長久以來，恐龍被認為像現(xiàn)代爬行動物一樣，是行動遲緩的“冷血動物”，需要依靠太陽熱量來調節(jié)體溫。而一項新研究表明，早在大約1.8億年前的侏羅紀早期，部分恐龍就已經進化出了從身體內部產生熱量的能力。

雖然人們常用“冷血”和“溫血”來區(qū)分動物的不同體溫調節(jié)方式，但這個描述并不確切。對應“溫血動物”，學界用內溫性（endothermy）來描述動物通過自身代謝產熱、調節(jié)和維持體溫的特性。此前研究表明，部分恐龍可能具有內溫性，但這種特性的演化時間節(jié)點并不清楚。

雪中的馳龍藝術圖，這是一類帶有羽毛的獸腳亞目恐龍。| 來源：Davide Bonadonna/Universidade de Vigo/UCL

研究人員利用化石數據集、古氣候模型和恐龍進化樹，研究了整個中生代恐龍在不同氣候條件下的繁衍遷徙路徑。中生代（2.51億年前至6600萬年前）是恐龍最為活躍的時期，可分為三疊紀、侏羅紀和白堊紀。這也是板塊、氣候、生物演化改變極大的時代。

結果發(fā)現(xiàn)，三大恐龍類群中的兩個——獸腳亞目（如霸王龍和迅猛龍）和鳥臀目（如劍龍和三角龍），在侏羅紀早期遷徙到了氣候較冷的地帶。這表明它們可能在這個時候已經演化出了內溫性。而另外一大類群——蜥腳亞目（如雷龍和梁龍），則生活在較溫暖的地區(qū)。分析表明，大約在1.83億年前，強烈的火山活動導致全球變暖、植物群滅絕。而內溫性的出現(xiàn)，可能也是這場環(huán)境危機所致。獸腳亞目和鳥臀目恐龍因此能夠在較冷的環(huán)境中高度活躍、長時間活動，從而更快生長發(fā)育，產生更多后代。

另一方面，“冷血”的蜥腳類恐龍進化出了巨大的體型，研究推測，這降低了身體的表面積和體積比，有助于減少熱量散失，使它們能夠在更長時間內保持活躍。

相關論文：
https://doi.org/10.1016/j.cub.2024.04.051

世界首位接受豬腎活體移植的患者去世

當地時間5月11日，美國馬薩諸塞綜合醫(yī)院（Massachusetts General Hospital）發(fā)布消息說，世界首位接受豬腎臟活體移植的患者——現(xiàn)年62歲的理查德·斯萊曼（Rick Slayman）于手術近兩個月后死亡。

馬薩諸塞綜合醫(yī)院在聲明中表示，沒有跡象表明斯萊曼的死亡是由腎臟移植造成的，“我們對他的信任和推動異種移植領域發(fā)展的意愿深表感激?！睋萍既請笙ⅲA中科技大學同濟醫(yī)學院附屬同濟醫(yī)院器官移植研究所副所長陳剛透露，患者死于突發(fā)心梗。

Rick Slayman | 來源：MGH

斯萊曼是一名終末期腎病患者，多年來患有2型糖尿病和高血壓，曾長期透析，于2018年接受了人腎臟移植手術，但幾年后移植腎臟出現(xiàn)衰竭跡象，不得不于2023年恢復透析。后來，斯萊曼出現(xiàn)血管通路相關并發(fā)癥，醫(yī)生建議其接受豬腎臟移植。美國食品藥品監(jiān)督管理局（FDA）基于“同情使用”規(guī)則批準了移植手術。

今年3月16日，馬薩諸塞綜合醫(yī)院經過4小時手術，成功將豬腎臟植入斯萊曼體內。此次手術使用的豬腎臟經過69處基因編輯，包括敲除會引起排異反應的基因、添加一些人類基因，以改善器官與人體的兼容性。此外，研究團隊讓豬體內的逆轉錄病毒基因失活，以防相關病毒影響人體。斯萊曼于4月出院，當時醫(yī)生預計這顆腎臟可以為他延長數年壽命，但同時也承認異種移植可能存在許多未知風險。

這是全球首例活體人類移植豬腎臟手術，被視為異種移植的里程碑事件。在此之前，美國曾進行兩例活體人類豬心臟移植手術，但兩名患者都在術后數月內死亡。去年7月，美國紐約大學蘭貢醫(yī)療中心團隊曾進行一例豬腎臟移植手術，受試者是一名已被判定為腦死亡的57歲男性。

OpenAI推出多模態(tài)模型GPT-4o，交談更像人

5月14日凌晨，OpenAI推出最新多模態(tài)模型GPT-4o（“o”代表omni，意為“全能”），帶來了更自然的人機交互，支持文本、音頻和圖像的任意組合輸入、輸出，反應速度近乎人類水平，還能通過語音語調或面部表情感知人類情緒。

據介紹，GPT-4o基于跨文本、視覺和音頻的端到端模型，所有輸入輸出均由同一個神經網絡處理。其在非英語文本方面的性能有顯著提高，視覺和音頻理解方面尤其出色。GPT-4o的速度是GPT-4 Turbo的2倍，而成本只有后者的一半。它可以在平均320毫秒、最短232毫秒的時間內響應音頻輸入，接近人類交談的反應速度。此前ChatGPT通過語音模式進行對話，平均延遲為2.8秒（GPT-3.5）和5.4秒（GPT-4），無法直接感知音調、多人講話和背景噪音，也無法發(fā)出笑聲、歌聲和表達情緒。

GPT-4o的文本和圖像功能將在ChatGPT更新后提供給所有用戶，Plus用戶的消息數量使用上限是免費版的5倍（達到上限后會切換回GPT-3.5版本）。而新版語音模式將在未來幾周向Plus用戶推出，同時也會通過API在小范圍內提供對GPT-4o新音頻和視頻功能的支持。

學生成績按“鬧”修改？西安科技大學通報處理結果

據央廣網報道，西安科技大學測繪科學與技術學院一名專職教師近日向記者反映：今年1月，自己所帶課程的期末成績出來后，一名成績不合格的學生家長以“影響孩子前途”“造成污點”為由，要求學生修改成績，并對老師進行語言上的威脅。學院相關人員也多次提到該家長“有背景”，要求老師修改成績。

另外該教師還反映，學院為了給另一位補考學生修改成績，在這名老師不知情的情況下，將課程的成績錄入權限從系統(tǒng)上轉移，由其他老師將不合格的成績修改為合格分數。

5月14日，西安科技大學對此發(fā)布情況通報：

經查，學生陳某某與王某某均參加了2024年4月8日《GNSS原理與應用》課程的補考，陳某某成績?yōu)?9分，成績屬實；王某某成績?yōu)?6分，后被教務員張某某和課程組長陳某更改為60分，經研究，認定更改成績無效。

認定教務員張某某一級教學事故，給予記過處分，調離原崗位；認定課程組長陳某三級教學事故，免去課程組長職務；認定分管教學副院長競某三級教學事故，給予警告處分；給予院長李某某警告處分；給予院黨委書記殷某某記過處分。

上網能夠提高幸福感

上網會讓你更幸福嗎？普遍看法是負面的，這種擔憂通常來自互聯(lián)網的消極一面：網絡霸凌、社交媒體成癮、身體外貌焦慮……而一項針對240萬人、歷時16年的全球性研究挑戰(zhàn)了上述認知，發(fā)現(xiàn)使用互聯(lián)網可能會提高人們的幸福感。

研究人員表示，此前同類研究存在片面性，超過90%的數據集來自少數英語國家，調查對象也以年輕人為主，所以他們試圖更全面地了解互聯(lián)網的影響。新研究通過蓋洛普世界民意調查的數據，分析了使用互聯(lián)網與八項幸福感指標之間的關系。這些數據橫跨2006年到2021年，通過電話或面對面采訪收集，涵蓋168個國家約240萬名15歲及以上的參與者。研究控制了收入水平、就業(yè)狀況、受教育水平和健康情況等可能的影響因素。結果發(fā)現(xiàn)，能夠上網的人在生活滿意度、積極體驗和社交生活滿意度方面的平均得分，比無法上網的人高出8%。

研究指出，在線活動可以幫助人們學習新事物、結交新朋友，可能會產生有益影響。這種積極影響類似于在大自然中散步帶來的健康益處。

不過，與不上網的人相比，15至24歲、在過去一周內使用過互聯(lián)網的女性，對自己居住地的平均滿意度偏低。這可能是因為那些在現(xiàn)實社區(qū)里不受歡迎的人會花更多時間上網。研究人員表示，還需要進一步研究，來確定互聯(lián)網和幸福感之間的關聯(lián)是出于因果關系，還是僅具有相關性。

相關論文：
https://doi.org/10.1037/tmb0000127

一周餓兩天，“脂肪肝”就有救？

“脂肪肝”通常指非酒精性脂肪性肝病（NAFLD），在中國已取代慢性乙型肝炎，成為最常見的慢性肝病。如果不加以控制和治療，可能會轉變?yōu)榇x功能障礙相關的脂肪性肝炎（MASH，非酒精性脂肪性肝炎），出現(xiàn)肝臟組織損害和纖維化，進而發(fā)展為肝硬化，甚至肝癌。

如果已經出現(xiàn)了脂肪肝，該如何控制和緩解呢？一項新研究帶來了好消息：不用減少總熱量攝入，只需簡單調整一下飲食模式，一周內留出兩個整天餓一餓，或許就可以防止脂肪性肝炎的發(fā)展。

這種飲食方案被稱為5:2間歇性斷食，重點是每周有不連續(xù)的2天禁食高熱量液體和食物（可以隨意飲水），每個禁食周期持續(xù)24小時。這屬于“間歇性斷食”的常用方案之一，其他較常見的間歇性斷食方案還有6:1，即一周內有一個24小時的周期保持禁食。研究人員通過小鼠模型試驗比較了不同的間歇性斷食方案，發(fā)現(xiàn)5:2間歇性斷食對預防和改善脂肪性肝炎的效果最好。

新研究模擬典型西方飲食給實驗組小鼠連續(xù)數月喂食了高糖、高脂肪飲食，在它們患上脂肪肝后讓部分小鼠開始采用間歇性斷食法。每個斷食周期一結束，這些小鼠就會立刻吃飽，所以每周攝入的總熱量并沒有減少。然而，它們的體重不再增加，也沒有出現(xiàn)代謝功能障礙，血樣指示肝損傷的生物標志物水平很低。分析發(fā)現(xiàn)，轉錄因子PPARα和糖代謝關鍵酶PCK1在禁食期間發(fā)生了顯著上調，它們共同作用，增加脂肪酸的分解和糖異生，并抑制脂肪堆積。研究人員表示，需要在人類患者中開展研究，以確定間歇性禁食是否也能像小鼠實驗中一樣預防慢性肝炎。

相關論文：
http://dx.doi.org/10.1016/j.cmet.2024.04.015

650多名學者聯(lián)名批評AlphaFold 3不透明，呼吁公開代碼

上周，谷歌DeepMind與Isomorphic Labs合作推出新一代AI生物分子結構模型AlphaFold 3，能夠以前所未有的精度，預測幾乎所有生命分子的結構和相互作用。但AlphaFold 3目前只能通過網絡服務器受限訪問，且其5月8日發(fā)表在Nature上的論文并未公開底層代碼。這招致了科學界的廣泛批評。截至5月14日，已有超過650名研究人員聯(lián)名簽署公開信，表示對論文不提供代碼感到“失望”，并批評期刊違背了自身關于代碼可用性的規(guī)定。

公開信寫道，“誠然，公司有權用自身創(chuàng)新謀利。但如果僅利用學術出版物背書，卻堵死復現(xiàn)成果、進一步研究的可能性，那么這對科學事業(yè)是一種破壞?！惫_信還批評Nature選擇性執(zhí)行政策“不公平”，“編輯決策與科學界需求相?！?。論文審稿人、結構生物學家Roland Dunbrack表示，在文章發(fā)表前，他曾多次要求提供代碼，但一直沒有回應。結構生物學家James Fraser表示，論文未說明理由、僅注明“不提供代碼”，似乎公然違反了期刊政策。Nature的投稿指南規(guī)定，支持論文主要觀點的代碼必須應要求提供給審稿人。其編輯政策規(guī)定，“作者必須及時向讀者提供代碼，不得有不適當的限制?！?/p>

除了每天20次（發(fā)布之初是10次）的使用限制，AlphaFold 3還限制分析對象的種類。據報道，由于和藥物發(fā)現(xiàn)公司Isomorphic Labs利益相關，AlphaFold 3無法預測蛋白質和新藥之間的相互作用。

對此，Nature主編Magdalena Skipper在一份聲明中回應稱：“Nature承認在某些情況下，可能無法公開研究數據或代碼?！本庉媯儠翱紤]許多因素，包括對生物安全的潛在影響，以及由此帶來的倫理挑戰(zhàn)?！彼硎?，論文給出了描述程序運行步驟的偽代碼，“提供了支持復現(xiàn)的替代方案?！盌eepMind方面表示，團隊將在6個月內放出AF3模型，供學術研究使用。

此前報道：AlphaFold 3來了：預測所有生物分子結構、相互作用

出品：科普中國

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