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[科普中國]-序列

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描述生物名詞

DNA分子是由4種核苷酸(A,T,G,C)排列組成,DNA序列就是組成某一DNA分子的核苷酸的排列次序。

蛋白質(zhì)的一級結(jié)構(gòu)是由20種氨基酸線性排列構(gòu)成。蛋白序列就是構(gòu)成某種蛋白質(zhì)如氨基酸線性排列次序。因此,測序(sequencing)就是用實(shí)驗(yàn)方法,測定DNA 分子中核苷酸的種類及其排列次序,或者測定蛋白質(zhì)分子中氨基酸的種類及其排列次序。人基因組測序是指測定構(gòu)成人基因組的約30億個(gè)核苷酸的種類及其排列次序。

基因組中的DNA序列可以分為兩大類:一類是單一序列,即在基因組中這種核苷酸的排列次序只出現(xiàn)一次或只有一份拷貝;另一類是重復(fù)序列。指某種核苷酸排列次序在基因組出現(xiàn)的次數(shù)或其拷貝數(shù)少則幾份,十幾份,多的可達(dá)幾萬份甚至幾十萬份。1

構(gòu)成基因的極大多數(shù)是單一序列。重復(fù)序列則基本上全是非編碼序列,它們的生物學(xué)功能是一個(gè)尚未解開的謎團(tuán)。

數(shù)學(xué)名詞在信息學(xué)里,序列表示離散時(shí)間信號。例如:物理信號x(n)等于單位階躍序列u(n),即x(n)=u(n),其時(shí)序n表示記錄物理信號的時(shí)間順序,u(n)的波形下圖所示。

參考《數(shù)字信號處理》楊毅明著p.34、p.38、p.69和p.85,機(jī)械工業(yè)出版社2012年發(fā)行。

信號名詞在離散時(shí)間信號中,若令相繼時(shí)刻t(k+1)與tk之間的間隔為時(shí)間常數(shù)T,則離散信號只在均勻離散時(shí)刻t=...,-2T,-T,0,T,2T,...時(shí)有定義,它可以表示為f(kT),這樣的離散信號也常稱為序列。2

例子和符號例如,(C,Y,R) 是一個(gè)字母的序列:順序是 C 第一,Y 第二,R 第三。序列可以是有限的(就像前面這個(gè)例子),也可以是無限的,就像所有正偶數(shù)的序列 (2,4,6,...)。有限序列包含空序列( ),它沒有元素。序列中的元素也稱為項(xiàng),項(xiàng)的個(gè)數(shù)(可能是無限的)稱為序列的長度。

序列寫作 (a1,a2, ...)。簡單起見,也可以用符號 (an)。

一個(gè)相對正式的定義:其項(xiàng)屬于集合 S的有限序列是一個(gè)從 {1,2,...,n} 到 S的函數(shù),這里 n≥0。屬于S的無限序列是從 {1,2,...}(自然數(shù)集合)到 S的函數(shù)。

有限序列也稱作 n 元組。一個(gè)從所有整數(shù)到到集合的函數(shù)有時(shí)也稱作雙無限序列,這里將以負(fù)整數(shù)索引的序列認(rèn)為是另一個(gè)以正整數(shù)索引的序列。

形式和性質(zhì)一個(gè)給定序列的子序列是從給定序列中去除一些元素,而不改變其他元素之間相對位置而得到的。

若序列的項(xiàng)屬于一個(gè)偏序集,則單調(diào)遞增序列就是其中每個(gè)項(xiàng)都大于等于之前的項(xiàng);若每個(gè)項(xiàng)都嚴(yán)格大于之前的項(xiàng),這個(gè)序列就是嚴(yán)格單調(diào)遞增的。類似可定義單調(diào)遞減序列。單調(diào)序列是單調(diào)函數(shù)的一個(gè)特例。

由整數(shù)組成的序列稱為整數(shù)列;由多項(xiàng)式組成的序列稱為多項(xiàng)式列。

若S具有拓?fù)洌敲淳涂梢杂懻揝中的無限序列的收斂。請?jiān)斠姌O限。

由數(shù)組成的序列稱為數(shù)列;由數(shù)列的部分和組成的序列稱為級數(shù),例如: