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[科普中國]-歷時四年,中國科學(xué)家創(chuàng)造了全世界第一個單染色體真核生物

我是科學(xué)家
原創(chuàng)

作者:鬼谷藏龍

編輯:小柒

“染色體”這個概念,大家多多少少應(yīng)該都有聽過。諸如動物、植物和真菌之類擁有復(fù)雜細(xì)胞結(jié)構(gòu)的生物(也就是真核生物),它們的遺傳物質(zhì)——DNA就存在這種叫做染色體的結(jié)構(gòu)上。

染色體結(jié)構(gòu)示意圖。圖片來源:pixabay

不同的真核生物所擁有的染色體數(shù)量可謂天差地別:比如人類擁有23對染色體,我們做實驗的小白鼠有20對染色體,家里的汪星人則有39對染色體。

可是你是否想過,生物的染色體數(shù)目為什么不一樣呢?

一般來說,表述越是簡單的問題就越能觸及知識的本質(zhì)。然而就像是最優(yōu)美簡潔的公式背后往往蘊含著最高深的智慧,染色體的數(shù)量問題,自染色體被發(fā)現(xiàn)以來就是生命科學(xué)領(lǐng)域的最大謎團之一。

生物的染色體數(shù)目為什么不一樣呢? 圖片來源:pixabay

首先, 染色體的數(shù)量和生物的復(fù)雜程度無關(guān), 單細(xì)胞的釀酒酵母擁有16條染色體,澳大利亞有一種螞蟻 Myrmecia pilosula 的雄蟻卻只有1條染色體,而一種小型蕨類植物 Ophioglossum reticulatum 的染色體數(shù)量則高達1260條。

其次, 染色體的數(shù)量和基因量也沒啥關(guān)系, 比如裂殖酵母和釀酒酵母的基因量差不多,生活方式也基本類似,但是裂殖酵母卻只有3條染色體。最后,染色體的數(shù)量在演化過程中也經(jīng)常改變,比如我們?nèi)祟愖罱慕H黑猩猩就比我們多一對染色體。

黑猩猩擁有24對染色體,比人類多一對。 圖片來源: pixabay

生物染色體數(shù)量竟能如此“狂放不羈”,以至于人們一切總結(jié)歸納的努力都顯得很徒勞。既然,無法從觀察中解決問題,我們能不能通過實驗來解決呢?也不行,因為長久以來科學(xué)家甚至連解決這個問題的第一步都無法邁出——以往的研究手段根本無法實現(xiàn)在改變某種生物的染色體數(shù)量的同時保持基因數(shù)量不變。

可以說,人們對于染色體數(shù)量這么個簡單問題,數(shù)十年來壓根一籌莫展。假說提了一大堆,有些甚至寫進了教科書里,但是實錘卻一點都沒有。

不過就在今年,終于有人把這重要的第一步給邁了出去。

就在8月2日,國際頂尖的科學(xué)期刊《自然》同時上線了兩篇重量級論文,一篇來自紐約大學(xué)系統(tǒng)遺傳學(xué)研究所的Jef Boeke團隊,他們成功 將釀酒酵母的16條染色體彼此“融合”,縮減到2條染色體 。而另一篇出自中科院上海生命科學(xué)研究院,植物生理生態(tài)研究所的覃重軍等實驗室則更進一步, 將釀酒酵母的全部16條染色體融合成了1條染色體 。

釀酒酵母在電子顯微鏡下的照片。圖片來源:wikipedia

其實他們采用的方法在原理上很好理解,整個過程就像是個 染色體“接龍” ——先去除兩條染色體兩端的端粒(相當(dāng)于摘掉染色體兩端的保護套)和其中一個染色體中央的著絲粒部分(否則融合出來的新染色體會有兩個著絲粒就很不穩(wěn)定),再在兩端放入一個可以介導(dǎo)染色體彼此連接的同源序列(作用相當(dāng)于一個彼此匹配的接口),然后兩條染色體就有一定的概率融合成一條。可以配合下圖想象一下這個過程。

染色體融合的原理大至相當(dāng)于把兩根電線的保護端剝開、各自加上一個可以互相匹配的接頭、再連接在一起。圖片制作:鬼谷藏龍

染色體融合過程在原文中示意圖。圖片來源:參考文獻[3]

雖然聽起來好像沒啥大不了的,但這種事放幾年前都無法想象。不過所幸, 借助于CRISPR/Cas9等最新的基因編輯技術(shù),這種方案在今天終于可能實現(xiàn)了。 盡管如此,它依舊是個非常艱辛的工作。

覃重軍團隊耗時四年,做了大量的嘗試才完成全部15輪染色體融合,構(gòu)建出一株只有一條染色體的酵母菌株。而Jef Boeke團隊所付出的努力想必也不會更少,卻最終也沒有將最后的兩條染色體融合在一起。

覃重軍構(gòu)建的全融合釀酒酵母染色體示意圖,這個巨大染色體的不同區(qū)段分別對應(yīng)原有的16條染色體。參考文獻[2]

而突破染色體融合的難關(guān)后,覃重軍的研究團隊又對此進行了深入的探究。他們發(fā)現(xiàn),將酵母的16條染色體融合成一條以后,原來染色體上的那些基因表達卻并沒有受什么影響,酵母的形態(tài)功能各方面,除了減數(shù)分裂略有異常外,全部都正常如初。

通過更進一步的研究,他們還發(fā)現(xiàn),染色體的融合強烈改變了 染色質(zhì)的大尺度結(jié)構(gòu) (【注】狹義上的染色體只有在細(xì)胞分裂時才會短暫出現(xiàn),那是一種DNA的濃縮狀態(tài),在大部分時候,細(xì)胞內(nèi)的DNA以一種松散的形態(tài)存在,這種狀態(tài)稱為染色質(zhì)),傳統(tǒng)理論認(rèn)為,大尺度的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)會影響基因的表達,而這項研究很可能顛覆原有的理論。

上圖左邊為野生型的釀酒酵母(16條染色體)的染色質(zhì)的空間結(jié)構(gòu),右圖是這16條染色體合體之后的染色質(zhì)形態(tài)。圖中藍色小球代表端粒,紅色小球代表著絲粒,同樣的顏色片段為互相對應(yīng)的染色體片段??梢钥闯?,染色體融合導(dǎo)致大尺度上的結(jié)構(gòu)變化,但是局部的染色質(zhì)形態(tài)則基本保持不變。參考文獻[3]

這項工作可以說將生命科學(xué)的某些領(lǐng)域推進到了一個全新的境界,我們無法知道這個境界里究竟有什么。覃重軍等科學(xué)家作為進入這一重新天地的先驅(qū),已經(jīng)瞥見了一些寶藏,卻也帶來了更多的未知——

染色體的長度真的沒有任何限制嗎?如果大尺度的染色質(zhì)結(jié)構(gòu)沒有意義,那為什么幾乎所有生物的染色質(zhì)都會在大尺度上表現(xiàn)出一些有序的結(jié)構(gòu)?既然一條染色體已經(jīng)夠用,為什么絕大多數(shù)真核生物都會選擇保留復(fù)數(shù)條染色體? Jef Boeke還發(fā)現(xiàn)當(dāng)釀酒酵母的染色體數(shù)融合成8條的時候突然就和普通的酵母產(chǎn)生了生殖隔離,這又是什么原因?

無限的問題,無限的可能在等待科學(xué)家們一個個去解讀,或許不久之后又會得出新的驚詫世人的成果呢?這染色體的數(shù)量之謎會不會像當(dāng)年物理學(xué)界的兩朵“小烏云”那樣,在撥云見日之際展現(xiàn)出一個驚艷的新世界來呢?想來還真是令人心潮澎湃呢!

作者名片

排版:小爽

參考文獻:

1. Luo, Jingchuan, Sun, Xiaoji, Cormack, Brendan P. & Boeke, Jef D. (2018). Karyotype engineering by chromosome fusion leads to reproductive isolation in yeast. Nature, 1476-4687.

2. Shao, Yangyang, Lu, Ning, Wu, Zhenfang, Cai, Chen, Wang, Shanshan, Zhang, Ling-Li, Zhou, Fan, Xiao, Shijun, Liu, Lin, Zeng, Xiaofei, Zheng, Huajun, Yang, Chen, Zhao, Zhihu, Zhao, Guoping, Zhou, Jin-Qiu, Xue, Xiaoli & Qin, Zhongjun. (2018). Creating a functional single-chromosome yeast. Nature, 1476-4687.

3. Nature News: Yeast chromosome numbers minimized using genome editing